Стручната и административната служба се организираат како интегрирана стручна и административна служба на Универзитетот, која ја сочинуваат Централната стручна и административна служба - Ректоратот и стручните и административни служби на единиците.
Службата на Универзитетот се организира по сектори, во согласност со функционалната поврзаност на дејноста на единиците на Универзитетот утврдени со Статутот на Универзитетот.
Со работата на Службата на Универзитетот раководи генералниот секретар на Универзитетот.